避免水性涂料变质发臭的关键在于全程管控防细菌污染和防腐杀菌剂失效。在生产环节，除了选用适合的防腐杀菌剂，还需重视用水质量、设备清洁以及包装物的洁净程度。注意着每一个细节，以确保产品的长久保存。同时，保证包装和储存环境的干燥、清洁也是非常关键的。从生产到包装及储存运输的过程中，每一步都要严格把关：

尽量避免涂料用水自带细菌。高温季节尽量避免使用已经发酸、有味的洗缸水，避免使用地下水，避免使用贮存了较长时间的贮罐水。最好使用经过消毒处理的纯净水或自来水，杜绝生产用水带来细菌的机会。

尽量避免原材料中带来细菌。水性涂料的原材料平时要存放在干燥、整洁的环境，避免在存放过程中感染细菌。尤其乳液要现开现用，一次用不完的一定要密封。

生产机器要保持清洁。尤其有些小厂，有时几天没生产，洗缸水就在缸内存放，砂磨机中料也易被细菌感染，生产前一定要清洗干净。包装桶、盖要保存在干燥整洁的环境中，这样降低霉变的可能性。

包装桶、贮罐建议要密封，以免给细菌可乘之机；运输、贮存过程中尽量避免太阳直射、高温。